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A cana-de-açúcar apresenta grande importância econômica principalmente para países tropicais e subtropicais. As perdas relacionadas a essa cultura são elevadas, no entanto,seus resíduos apresentam grande versatilidade de uso, o que permite seu aproveitamento total, tanto para produção de açúcar e etanol, quanto como forrageira para animais e geração de energia de segunda geração através do bagaço. O desenvolvimento de novas variedades a partir do melhoramento genético permite a ampliação do agronegócio da cana-de-açúcar e o consequente movimento da economia. A incorporação de nova variabilidade genética é uma ferramenta importante para ampliar a base genética de seleção dos programas de melhoramento genético a fim de obter progênies melhoradas. O objetivo do presente trabalho foi avaliar marcadores moleculares TRAP ligados a genes relacionados à síntese de sacarose e lignina e elucidar a estrutura genética populacional das variedades australianas e brasileiras. Foram avaliadas 14 variedades de cana-de-açúcar australianas e 20 brasileiras através dos marcadores moleculares TRAP associados a genesrelacionados à síntese de sacarose e lignina. O DNA dos acessos foi extraído a partir dos primórdios foliares usando o método CTAB e as amplificações dos marcadores relacionados com sacarose e lignina foram realizadas conforme descrito na literatura. A detecção dos produtos amplificados foi realizada através de eletroforese em gel de poliacrilamida 6% corado com nitrato de prata. Os fragmentos foram classificados em “1” (presença) e “0” (ausência) e as matrizes binárias geradas foram utilizadas para realizar análises posteriores. Foram gerados 763 fragmentos, dos quais 71% foram polimórficos nos genótipos avaliados. Um total de 10 fragmentos grupo-específicos e 55 fragmentos variedade-específicos foram detectados. Os resultados obtidos pela Análise de Variância Molecular (AMOVA) apontaram que, em geral, 26% da variação total encontrada é distribuída entre os grupos A e B, enquanto 74% da variação encontrada é distribuída dentro dos grupos predefinidos.Os valores de dissimilaridade média de Jaccard entre as populações australianas e brasileiras para os marcadores TRAP de sacarose, lignina e sacarose junto com lignina foram 0,3382, 0,3681 e 0,3441, respectivamente. Em relação às análises de componentes principais para os marcadores TRAP de sacarose, lignina e sacarose junto com lignina, os dois primeiros componentes principais em conjunto (PCs) explicaram 25,1%, 21,3% e 23,2% da variação detectada, respectivamente. Os resultados obtidos pelas árvores filogenéticas através das dissimilaridades de Jaccard, as PCAs e os resultados da estrutura genética da população (STRUCTURE) evidenciaram nítida separação entre as duas populações australianas e brasileiras. As análises oriundas desses resultados poderão auxiliar programas de melhoramento genético na orientação de possíveis cruzamentos. Os dados coletados poderão orientar cruzamentos entre indivíduos do germoplasma brasileiro e australiano, o que poderá auxiliar os programas de melhoramento genético na obtenção de variedades mais ricas e produtivas.

Saccharum; marcadores moleculares; germoplasma