A Cromatografia Circular de Pfeiffer (CCP) é um indicador qualitativo do solo, de baixo custo, acessível e tem mostrado grande potencial nos estudos em Agroecologia. Dentre os diversos tipos de manejos agroecológicos existem os Sistemas Agroflorestais (SAF), que são um conjunto de práticas agrícolas que reproduz os processos ecológicos da floresta unido a produção de alimentos ao mesmo tempo que restaura a qualidade do solo e serviços ecossistêmicos. Para monitorar as mudanças provocadas pelo manejo agroflorestal no solo são utilizados indicadores da qualidade do solo, com destaque para os bioindicadores, principalmente os microrganismos, que respondem rapidamente às mudanças ambientais. Á vista disto, o objetivo deste trabalho foi analisar a qualidade do solo de um Sistema Agroflorestal com diferentes formas de manejo, durante o período de 12 meses, utilizando indicadores microbiológicos e parâmetros químicos do solo, correlacionados com a CCP. A área de estudo localiza-se no campus da UFSCar Sorocaba-SP dividida nas seguintes parcelas: SAF controle, SAF manejado, Área de Pousio e Fragmento de Mata Atlântica. No SAF manejado foi aplicado manejo agroflorestal uma vez por mês, durante 12 meses, enquanto o SAF controle permaneceu sem nenhuma intervenção de manejo durante todo o período do experimento. As amostras de solo foram coletadas nas profundidades de 0-10 cm e 10-20 cm, nas estações seca e chuvosa. Analisou-se as amostras de solo utilizando a CCP e os seguintes indicadores: bactérias heterotróficas mesófilas totais, fungos totais, pH, umidade e matéria orgânica. Para a CCP, utilizou-se papel de filtro Whatman Nº 4, hidróxido de sódio a 1%, nitrato de prata a 0,5% e 10 dias de revelação indireta com a luz solar. Tanto para bactérias quanto para os fungos foi realizada contagem das Unidades Formadoras de Colônia (UFC/g de solo), sendo os meios de cultura Plate Count Ágar e Sabouraud, respectivamente. Não foram encontradas diferenças significativas entre as profundidades de amostragem 0-10 cm e 10-20 cm para todos os indicadores em todas as parcelas amostradas. Constatou-se que não houve diferença significativa entre o SAF controle e o SAF manejado, no período estudado, para todos os indicadores analisados. A CCP, as bactérias heterotróficas mesófilas totais e os fungos totais mostraram-se sensíveis a sazonalidades entre as estações seca e chuvosa. Houve correlação positiva demonstrado pela zona central (zona de aeração) da CCP, com matéria orgânica (r=0,93) e umidade do solo (r=0,95). Dessa forma, a intensidade do manejo aplicado no SAF Experimental não foi suficiente para causar mudanças significativas na qualidade do solo, durante o período avaliado.