O perfil químico de uma espécie pode ser avaliado a partir de diferentes técnicas e análises, o presente trabalho direcionou o estudo da espécie de Citrus sinensis, caracterizada pela presença das classes de cumarinas, flavonoides, alcalóides e limonóides, com grande quantidade de compostos prenilados encontrados neste gênero. A espécie de Citrus sinensis (enxertado em C. limonia) pertencente à família das Rutaceae, tem em sua composição química metabólitos responsáveis pela resposta de defesa frente a fitopatógenos (fungos e bactérias), quando ocorre ativação da via Biosintética.¹ O perfil químico da planta foi avaliado por análise metabolômica utilizando cromatografia líquida hifenizada com espectrometria de massas de alta resolução(LC-HRMS), e a aquisição dos dados abordada por ferramentas quimioinformáticas direcionou a busca por substâncias de citros de diferentes classes. Os dados brutos de LC-HRMS requerem alto processamento e ferramentas como MS-DIAL (para deconvolução, alinhamento, detecção e diferenciação do cromatograma) e MS-FINDER (para geração de fórmula molecular e banco de dados de compostos relatados) foram utilizadas para suportar o tratamento dos dados. Além disso, a plataforma GNPS [Rede Molecular Social de Produto Natural Global, (https://gnps.ucsd.edu/)] viabilizou a criação e construção de redes moleculares (MN)  que associada ao MS-DIAL ² e MS-FINDER ³ permitiram a anotação de vários metabóitos de C. sinensis (enxertado em C. lionia) já identificados e caracterizados por RMN-1D e 2D e outras técnicas. A anotação das substâncias foi suportada por bancos de dados de metabólitos como PlantCyc (Planta), UNPD e NANPDB (Produto Natural) e PunChem (Biomoléculas). Posteriormente, a criação da rede molecular com tolerância de massa do íon precursor 0,02Da e 0,06Da para o íon fragmento, com mínimo de 5 íons fragmentos emparelhados e 0,7 de parâmetro cosseno para a rede molecular. O estudo por análise metabolômica associado as ferramentas permitiram a anotação de 17 metabólitos secundários de Citros, dentre as classes, flavonas (4 ', 5,6,7-tetra-O-metoxiflavona, tangeretina, isosinensetina, 3', 4', 3,5,7-pentametoxiflavona, nobiletina, gardenina B e 3- metoxinobiletina), flavanona (hesperidina), limonóides (limonina e acetato de limonila), alcalóides (5-hidroxinoracronicina), cumarinas (xantiletina, suberosina, escoparona, seselina, xantoxiletina e suberenol) acompanhados da proposta de mecanismo de fragmentação.⁴ Os dados obtidos resultaram na tentativa de anotação e identificação de flavonas (tetra-O-metilescutelarina, tangeretina, nobiletina), limonóides (limonina e acetato de limonila) e cumarinas (xantiletina, escopoletina, seselina) que foram comparadas com a literatura⁵, mostrando resultados promissores para continuar a busca por outros já relatados, e por novas moléculas dessas espécies.