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Previsão em modelos filogenéticos
Luben Miguel Cabezas, Rafael Bassi Stern

Última alteração: 2021-02-25

Resumo


Um modelo filogenético é caracterizado pela representação das relações de descendência e ascendência entre indivíduos e espécies num contexto de evolução histórica. Uma maneira de retratar tais relações e hierarquias é por meio de uma árvore (costumeiramente binária). Na área de filogenética tem-se sempre o interesse em estimar topologias e tempos de divergência de espécies (tamanhos de galhos). Baseado em tal motivação, esta iniciação implementou o algoritmo de Felsenstein (1981) para otimização das arestas da árvore, juntamente com a função de predição com relação à configuração genética dos filhos. Posteriormente foi realizado um estudo de simulação sobre a capacidade preditiva do algoritmo de máxima verossimilhança sobre a topologia da árvore. Obteve-se como principal resultado a preservação das relações entre pais e filhos da árvore original quando esta é simulada. O algoritmo de Felsenstein também foi comparado com o método e dados em Sanson (2002), obtendo-se resultados similares.  U dam modelo logenetico e caracterizado pela representac~ao das relac~oes dedescend^encia e ascend^encia entre indivduos e especies num contexto de evoluc~aohistorica. Uma maneira de retratar tais relac~oes e hierarquias e por meio de umaarvore (costumeiramente binaria) como a retratada abaixo.

Palavras-chave


Filogenética, Predição, Máxima verossimilhança